行政机关和参照公务员法管理单位在性质、职能、人员管理等方面存在一些不同：
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1. 性质：
行政机关：是依法设立的、负责国家行政事务管理的国家机关，具有行政权力，是国家的行政机关。
参照公务员法管理单位：是指按照公务员法的规定，参照公务员法管理的单位，这些单位并非国家机关，但因其工作性质、职责等与行政机关相似，故参照公务员法进行管理。
2. 职能：
行政机关：负责制定和执行国家政策、法规，管理国家行政事务，保障国家安全、维护社会稳定等。
参照公务员法管理单位：主要负责本单位的内部管理、业务工作等，其职能范围相对较小。
3. 人员管理：
行政机关：按照公务员法进行人员管理，包括录用、考核、晋升、培训、奖惩等。
参照公务员法管理单位：参照公务员法进行人员管理，但具体实施过程中，可能根据单位实际情况进行调整。
4. 权力：
行政机关：具有行政权力，可以依法对行政相对人进行行政处罚、行政许可等。
参照公务员法管理单位：不具有行政权力，其工作职责和权限主要来源于单位内部规定和上级机关授权。
5. 财务管理：
行政机关：属于财政全额拨款单位，其经费由财政部门统一管理。
参照公务员法管理单位：可能属于财政差额拨款或自收自支单位，其经费来源相对多样化。
行政机关和参照公务员法管理单位在性质、职能、人员管理等方面存在一定差异，但两者都遵循国家法律法规，共同为国家和人民服务。
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